I． 概要と背景
　最近の分子コンピューティング ―― 萩谷　昌己
　分子計算の現状
　　　　−DNA８の話題から− ―― 西川　明男
　分子プログラミング
　　　　−分子コンピューティングの設計論− ―― 萩谷　昌己
　ウエット進化計算 ―― 山村　雅幸

II． 理論とシミュレーション
　分子計算の理論モデル ―― 小林　聡・榊原　康文・横森　貴
　生体分子と計算 ―― 坂本　健作
　ＤＮＡの配列設計 ―― 有田　正規
　ＤＮＡの逆フォールディングと構造変化経路の解析 ―― 久保田　光宏・萩谷　昌己
　仮想バネモデルによる自己組織的なかたちづくり ―― 村田　智

III．さまざまなモデル
　分子コンピューティングの新しいモデル
　　　　−有限状態オートマトンの２つの新しい実装方法− ―― 榊原　康文
　無配線分子コンピューティング ―― 青木　孝文・平塚　眞彦・樋口　龍雄
　分子メモリー
　　　　−アクエアスコンピュータの分子生物学的実現− ―― 山村　雅幸
　光を用いたＤＮＡ操作技術の開発
　　　　−光分子コンピューティングへの応用をめざして− ―― 小倉　裕介・川上　高志・住山　文香・谷田　純

IV． 実装と応用
　分子プログラミング
　　　　−大容量分子メモリと分子錠− ―― 萩谷　昌己・山本　雅人・亀田　充史
　分子計算から展開したＤＮＡナノテクノロジーの動向 ―― 西川　明男
　インタビュー：ＤＮＡコンピュータの現状と将来 ―― 陶山　明